发票金额大于实际支付金额怎么做账

当发票金额大于实际支付金额时，应当采取以下处理措施进行做账：

1、首先，如果该发票于收款账户相匹配，则要检查该发票的前后账存在不匹配的情况；

2、其次，要查看收款账户的余额，确认准确无误，并着重检查是否有重复收取费用的情况；

3、再次，要核实发票金额是否正确，如发票金额小于实际支付金额，可能存在折扣，或其他原因；

4、最后，应当尽快及时进行付款，以免造成拖欠应付款情况，导致公司财务出现滞后。

拓展知识：发票金额大于实际支付金额的情况，还可能是收取的费用存在其他形式的变动，比如服务费、附加税额、优惠积分数额等，如果出现这些情况，则要核实发票是否存在比实际支付金额还高的其他费用，以确保准确无误。